Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB1P08034 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB1P08034 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB1P08034 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJB1P08034 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJB1P08034 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJB1P08034 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJB1P08034 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB1P08034 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB1P08034 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB1P08034 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJB1P08034 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJB1P08034 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms