Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLK3P07288 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLK3P07288 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLK3P07288 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLK3P07288 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLK3P07288 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLK3P07288 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLK3P07288 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLK3P07288 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLK3P07288 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLK3P07288 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLK3P07288 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms