Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGKV5-2P06315 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGKV5-2P06315 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms