Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN1P04843 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN1P04843 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN1P04843 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN1P04843 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN1P04843 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN1P04843 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN1P04843 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPN1P04843 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPN1P04843 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN1P04843 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN1P04843 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN1P04843 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN1P04843 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RPN1P04843 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN1P04843 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN1P04843 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN1P04843 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN1P04843 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN1P04843 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN1P04843 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN1P04843 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPN1P04843 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN1P04843 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN1P04843 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN1P04843 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN1P04843 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN1P04843 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN1P04843 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN1P04843 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms