Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYBBP04839 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYBBP04839 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYBBP04839 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYBBP04839 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYBBP04839 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYBBP04839 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYBBP04839 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYBBP04839 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYBBP04839 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYBBP04839 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms