Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB4AP04350 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB4AP04350 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms