Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTLL1O95922 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTLL1O95922 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms