Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR1AO95602 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POLR1AO95602 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
POLR1AO95602 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms