Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTDNEP1O95476 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1O95476 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms