Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPLNO95428 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPLNO95428 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms