Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB5O95377 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB5O95377 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB5O95377 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB5O95377 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB5O95377 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB5O95377 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB5O95377 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJB5O95377 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJB5O95377 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB5O95377 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB5O95377 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB5O95377 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB5O95377 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB5O95377 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB5O95377 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB5O95377 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB5O95377 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms