Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAPBO95292 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAPBO95292 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VAPBO95292 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VAPBO95292 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAPBO95292 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAPBO95292 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAPBO95292 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAPBO95292 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAPBO95292 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms