Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD4O95243 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD4O95243 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD4O95243 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD4O95243 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD4O95243 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MBD4O95243 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD4O95243 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms