Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC1O94876 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC1O94876 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms