Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKAP2O75563 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKAP2O75563 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKAP2O75563 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKAP2O75563 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SKAP2O75563 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms