Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX16O60231 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX16O60231 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX16O60231 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX16O60231 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX16O60231 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX16O60231 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX16O60231 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX16O60231 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX16O60231 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX16O60231 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms