Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC3O43617 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3O43617 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms