Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B1O43520 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8B1O43520 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms