Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTSS1O43312 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTSS1O43312 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms