Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPAA1O43292 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPAA1O43292 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms