Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SART1O43290 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SART1O43290 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SART1O43290 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SART1O43290 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SART1O43290 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SART1O43290 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SART1O43290 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SART1O43290 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SART1O43290 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SART1O43290 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SART1O43290 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SART1O43290 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SART1O43290 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms