Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYNJ2O15056 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
SYNJ2O15056 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYNJ2O15056 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms