Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APAF1O14727 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APAF1O14727 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APAF1O14727 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APAF1O14727 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APAF1O14727 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APAF1O14727 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APAF1O14727 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
APAF1O14727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APAF1O14727 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APAF1O14727 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APAF1O14727 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms