Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MEIS1O00470 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MEIS1O00470 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms