Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01387J3KSC0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01387J3KSC0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms