Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms