Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L12C9JPN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L12C9JPN9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms