Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM49D1C9J1S8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM49D1C9J1S8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms