Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVV-2B6SEH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms