Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMTNL1A8MU46 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNL1A8MU46 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms