Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZSWIM8A7E2V4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZSWIM8A7E2V4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZSWIM8A7E2V4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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