Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NNZ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NNZ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A6NNZ2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NNZ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NNZ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NNZ2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A6NNZ2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NNZ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NNZ2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NNZ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms