Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM200CA6NKL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TMEM200CA6NKL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM200CA6NKL6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms