Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC160A6NGH7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC160A6NGH7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms