Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf92A6NGG3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms