Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP17L4A6NCW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L4A6NCW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms