Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPDC1A2A3K4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPDC1A2A3K4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms