Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLRN2A0PK11 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLRN2A0PK11 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLRN2A0PK11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms