Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A087X1B8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A087X1B8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A087X1B8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087X1B8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087X1B8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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