Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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