Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV0

Cryba4, Beta-crystallin A4, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba4Q9JJV0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cryba4Q9JJV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cryba4Q9JJV0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cryba4Q9JJV0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cryba4Q9JJV0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cryba4Q9JJV0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cryba4Q9JJV0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cryba4Q9JJV0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cryba4Q9JJV0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cryba4Q9JJV0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cryba4Q9JJV0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms