Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hipk3Q9ERH7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hipk3Q9ERH7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hipk3Q9ERH7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hipk3Q9ERH7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hipk3Q9ERH7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hipk3Q9ERH7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hipk3Q9ERH7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hipk3Q9ERH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hipk3Q9ERH7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk3Q9ERH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms