Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 216.15■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-207ENST00000504212 534 ntTSL 416.12■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-213ENST00000508805 428 ntTSL 316.03■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 CEP131-204ENST00000570482 613 ntTSL 515.93■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-219ENST00000514121 873 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-206ENST00000466956 574 ntTSL 414.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 XPC-202ENST00000427795 820 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-207ENST00000558362 3911 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-203ENST00000451526 450 ntTSL 214.82□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-208ENST00000558537 493 ntTSL 414.11□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 313.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-216ENST00000488551 552 ntTSL 412.6□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-201ENST00000518070 589 ntTSL 312.5□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-220ENST00000493338 694 ntTSL 312.28□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PRR7-AS1-201ENST00000425316 741 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 MIR6785-201ENST00000618984 81 ntBASIC11.86□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-217ENST00000510476 773 ntTSL 310.63□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-212ENST00000561148 903 ntTSL 510.27□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-201ENST00000261531 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 45.2
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BUD13Q9BRD0 GATM-211ENST00000560538 549 ntTSL 39.74□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ATP2C1-215ENST00000508660 943 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-205ENST00000521382 338 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PRR7-AS1-202ENST00000506465 421 ntTSL 37.74□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-206ENST00000556428 1966 ntTSL 27.73□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 56.58□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-203ENST00000554324 584 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-202ENST00000553565 564 ntTSL 25.71□□□□□ -1.52e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ATP2C1-206ENST00000504571 786 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 519.57■□□□□ 0.723e-12■■■■■ 45.1
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.473e-12■■■■■ 45.1
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BUD13Q9BRD0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-12■■■■■ 45.1
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 514.03□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 45.1
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-204ENST00000415904 649 ntTSL 313.45□□□□□ -0.263e-12■■■■■ 45.1
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-206ENST00000435123 389 ntTSL 59.63□□□□□ -0.873e-12■■■■■ 45.1
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 57.63□□□□□ -1.193e-12■■■■■ 45.1
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BUD13Q9BRD0 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.495e-22■■■■■ 45
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BUD13Q9BRD0 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.255e-22■■■■■ 45
BUD13Q9BRD0 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.355e-22■■■■■ 45
BUD13Q9BRD0 RPL36A-207ENST00000489407 373 ntTSL 26.3□□□□□ -1.45e-22■■■■■ 45
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BUD13Q9BRD0 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.956e-11■■■■■ 44.8
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BUD13Q9BRD0 KMT2C-203ENST00000360104 11186 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.512e-10■■■■■ 44.7
BUD13Q9BRD0 PLXNA3-209ENST00000497802 729 ntTSL 217.01■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 44.5
BUD13Q9BRD0 COL16A1-209ENST00000470799 826 ntTSL 518.38■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 44.4
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BUD13Q9BRD0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-206ENST00000503447 585 ntTSL 318.02■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 44.2
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BUD13Q9BRD0 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-224ENST00000635234 484 ntTSL 514.51□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-212ENST00000506169 572 ntTSL 412.52□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-205ENST00000503306 541 ntTSL 512.52□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-222ENST00000514685 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-207ENST00000504338 751 ntTSL 39.97□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 410.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.72e-28■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 318.59■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 44.1
BUD13Q9BRD0 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.83□□□□□ -0.22e-15■■■■■ 44.1
BUD13Q9BRD0 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 222.32■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 44
BUD13Q9BRD0 SOX5-203ENST00000396007 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-17■■■■■ 44
BUD13Q9BRD0 DNPEP-202ENST00000322176 925 ntTSL 324.15■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-221ENST00000523527 565 ntTSL 219.43■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-207ENST00000430206 577 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-208ENST00000434339 638 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-217ENST00000520694 673 ntTSL 315.99■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-210ENST00000460963 1610 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-215ENST00000519698 482 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-216ENST00000519905 576 ntTSL 411.28□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 HSD17B7-206ENST00000470195 593 ntTSL 34.83□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 43.6
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 3229.4 ms