Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 216.15■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-207ENST00000504212 534 ntTSL 416.12■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-213ENST00000508805 428 ntTSL 316.03■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 CEP131-204ENST00000570482 613 ntTSL 515.93■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-219ENST00000514121 873 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-206ENST00000466956 574 ntTSL 414.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 XPC-202ENST00000427795 820 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-207ENST00000558362 3911 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-203ENST00000451526 450 ntTSL 214.82□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-208ENST00000558537 493 ntTSL 414.11□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4G-203ENST00000476171 393 ntTSL 313.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-216ENST00000488551 552 ntTSL 412.6□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-201ENST00000518070 589 ntTSL 312.5□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ABCB8-220ENST00000493338 694 ntTSL 312.28□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PRR7-AS1-201ENST00000425316 741 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 MIR6785-201ENST00000618984 81 ntBASIC11.86□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SPOP-217ENST00000510476 773 ntTSL 310.63□□□□□ -0.712e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-212ENST00000561148 903 ntTSL 510.27□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-201ENST00000261531 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-210ENST00000559885 579 ntTSL 29.74□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 GATM-211ENST00000560538 549 ntTSL 39.74□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ATP2C1-215ENST00000508660 943 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-205ENST00000521382 338 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 PRR7-AS1-202ENST00000506465 421 ntTSL 37.74□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-206ENST00000556428 1966 ntTSL 27.73□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.352e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 56.58□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-203ENST00000554324 584 ntTSL 56.34□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 SNW1-202ENST00000553565 564 ntTSL 25.71□□□□□ -1.52e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 ATP2C1-206ENST00000504571 786 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-9■■■■■ 45.2
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-207ENST00000445505 515 ntTSL 519.57■□□□□ 0.723e-12■■■■■ 45.1
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BUD13Q9BRD0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-12■■■■■ 45.1
BUD13Q9BRD0 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 514.03□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 45.1
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BUD13Q9BRD0 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.255e-22■■■■■ 45
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BUD13Q9BRD0 SMUG1-218ENST00000511522 561 ntTSL 320.62■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-206ENST00000503447 585 ntTSL 318.02■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 44.2
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BUD13Q9BRD0 SMUG1-224ENST00000635234 484 ntTSL 514.51□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-201ENST00000243112 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-212ENST00000506169 572 ntTSL 412.52□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-205ENST00000503306 541 ntTSL 512.52□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-222ENST00000514685 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-207ENST00000504338 751 ntTSL 39.97□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 410.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.72e-28■■■■■ 44.2
BUD13Q9BRD0 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 318.59■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 44.1
BUD13Q9BRD0 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.83□□□□□ -0.22e-15■■■■■ 44.1
BUD13Q9BRD0 HES1-202ENST00000476918 1009 ntTSL 222.32■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 44
BUD13Q9BRD0 SOX5-203ENST00000396007 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-17■■■■■ 44
BUD13Q9BRD0 DNPEP-202ENST00000322176 925 ntTSL 324.15■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-221ENST00000523527 565 ntTSL 219.43■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-207ENST00000430206 577 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-208ENST00000434339 638 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-217ENST00000520694 673 ntTSL 315.99■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-210ENST00000460963 1610 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-215ENST00000519698 482 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 DNPEP-216ENST00000519905 576 ntTSL 411.28□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 HSD17B7-206ENST00000470195 593 ntTSL 34.83□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 43.7
BUD13Q9BRD0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 43.6
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 3229.4 ms