Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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