Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD2Q96BF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMIGD2Q96BF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIGD2Q96BF3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMIGD2Q96BF3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMIGD2Q96BF3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMIGD2Q96BF3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD2Q96BF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms