Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB2BQ8WUD1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB2BQ8WUD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB2BQ8WUD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB2BQ8WUD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB2BQ8WUD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB2BQ8WUD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB2BQ8WUD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms