Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5X7

EIF4E3, Eukaryotic translation initiation factor 4E type 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4E3Q8N5X7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF4E3Q8N5X7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF4E3Q8N5X7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF4E3Q8N5X7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF4E3Q8N5X7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EIF4E3Q8N5X7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF4E3Q8N5X7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF4E3Q8N5X7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EIF4E3Q8N5X7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms