Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ccdc73Q8CDM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc73Q8CDM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ccdc73Q8CDM4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Ccdc73Q8CDM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc73Q8CDM4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Ccdc73Q8CDM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ccdc73Q8CDM4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ccdc73Q8CDM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc73Q8CDM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc73Q8CDM4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc73Q8CDM4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms