Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa20Q45VN2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa20Q45VN2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa20Q45VN2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Defa20Q45VN2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa20Q45VN2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Defa20Q45VN2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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