Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdgfl2Q3UMU9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdgfl2Q3UMU9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdgfl2Q3UMU9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdgfl2Q3UMU9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms